Proteobakterie produkují ve významném množství LPS (lipopolysacharid), což je v zásadě toxin (endotoxin). Různé bakterie produkují různé verze LPS a proteobakterie tvoří nejprozánětlivější varianty LPS. Náš imunitní systém na tyto toxiny reaguje tak, že spouští v celém těle mírný a mnohdy i obtížně detekovatelný zánět, který se může manifestovat velice nespecificky jako například různé trávicí potíže, nevysvětlitelné autoimunitní reakce, široké spektrum psychických problémů jako deprese, paniky, mozkovou mlhu a stálou nevyřešitelnou únavu, kterou dnes trpí velká část naší populace. Mezi další v zásadě vážné komplikace patří zánět v cévách, srdeční potíže, obezita, cukrovka, jaterní onemocnění a mnoho dalších zdravotních potíží, které zpravidla nastupují plíživě a medicína je dovede dosti obtížně řešit, nebo spíše pouze potlačovat.

V zásadě tedy nebudu daleko od pravdy když si dovolím tvrdit, že stav většiny civilizačních onemocnění přímo koreluje s hladinou LPS a snížením hladiny LPS se lze naprosté většiny civilizačních chorob zbavit, nebo je minimálně dostat pod kontrolu. Z výše uvedeného je tedy celkem jasné, že čím méně proteobakterií si budeme ve svém střevě pěstovat, tím nižší budou hladiny LPS a tím lépe se nám bude dařit řešit své zdravotní potíže. Dokonce i v případě, že nám konkrétní proteobakterie ve střevě produkují LPS, lze alespoň omezit pronikání tohoto endotoxinu do těla omezením konzumace nasycených tuků a alkoholu a je nutné vyřešit děravé střevo. Jednoznačně je vhodné odstranit ze svého jídelníčku vše co propustnost střeva zvyšuje a hlavně z léčiv vyřadit NSAID přípravky ať již volně prodejné nebo na předpis protože ty zásadně zvyšují právě propustnost střeva. Mezi běžné volně prodejné NSAID patří ibuprofen (Advil, Motrin) a naproxen (Aleve).

Další důležitá věc co je potřeba vědět a udělat je pochopit že LPS odstraňují z těla játra rozkládáním procesem zvaným deacetylace a část vylučují přímo do žluče, která se ovšem přes děravé střevo může zase dostávat zpět do krevního řečiště, tedy zacelení střeva a masivní podpora jater je stěžejní úkol pokud se hodlám svých zdravotních potíží zbavit. Na podporu jater je vhodné nasadit byliny a pro zvýšení funkceschopnosti jater je podstatné srovnat hladinu zinku do optimální hodnoty kvůli enzymu alkalická fosfatáza (ALP) nutného k rozkladu LPS.

Při eliminaci proteobakterií se vyskytují určitá úskalí o kterých je dobré vědět a vyhnout se tak případným dalším zbytečným potížím. Podstatná část proteobakterií při svém vymírání vypouští daleko intenzivněji obsažený LPS do krve a tím vzniká enormní zátěž na vylučovací orgány v medicíně běžně popisovaná jako HERX reakce, správně Jarischova-Herxheimerova reakce, což je vlastně odezva organizmu na endotoxin z rozpadlých bakterií tedy v zásadě různě silná otrava organizmu. Tento problém nenastává pouze při aplikaci tvrdě působících medicínských přípravků, jako jsou například specifická antibiotika určená pouze pro vyčištění střevního traktu třeba Normix, ale vyvolat ho mohou i přírodní přípravky z bylin jako berberin, oregano, tymián a další. Z výše uvedeného plyne že vymírání je potřeba citlivě řídit, aby uvedené HERX reakce byly minimalizovány a průběh léčby byl pokud možno bezproblémový.

Eliminace proteobakterií by mohla být pro lepší pochopení vysvětlena i jako válečný stav vyhlášený konkrétnímu etniku na konkrétním území (v tomto případě naše střevo) s cílem jeho vyhlazení, což lze provádět různě tvrdou formou. Od těch přímých, tedy jak bylo výše zmíněno pouhým vybíjením protivníka, ale i nepřímo postupným přesidlováním konkrétního území novým etnikem v našem případě pomocí přátelských bakterií. Zde se velice osvědčilo podporování a dodávání prospěšných druhů bakterií, hlavně jde o producenty butyrátu, například Lactobacillus a Bifidobacterium, které snižují pH tlustého střeva. Proteobakterie špatně prosperují v kyselejším prostředí, tedy optimální pH vaší stolice by se mělo pohybovat v rozmezí 5-6,5 pH. Velkým pomocníkem je v západních společnostech poměrně málo známá bakterie Bacillus subtilitis (česky bacil senný), kterou naopak přímo miluje východní kuchyně a takovým klasickým příkladem jídla bohatého na tento druh bakterie je NATTO. Když už se bavíme o válčení tak v tomto případě NATTO není známý vojenský pakt, ale Nattō (納豆) je tradiční japonské jídlo vyrobené z celých sójových bobů, které byly fermentovány pomocí Bacillus subtilis var.natto. Tuto specifickou poživatinu lze zakoupit v prodejnách zdravé výživy, nebo si ji vyrábět doma a i když asi nepůjde o potravinu, která každému nemocnému bude chutnat v zásadě téměř každému může prospět.

Takto vypadá uvedená bakterie Bacillus subtilis a sojové Natto :